Svoju futbalovú kariéru začínal ako malý chlapec na ihrisku vo Vinohradoch.
Bol veľmi talentovaný, čo si všimli aj funkcionári zo Slovanu Bratislava a tak sa mladý Peter dostal na Tehelné pole. Za Slovan hrával v rokoch 1985 – 1993.
„Belasí“ potrebovali do tímu presne človeka ako on – elegantného a vzdelaného na trávniku aj mimo neho. Netrvalo dlho a stal sa z neho líder a kanonier, akého si priali.
Peter bol ofenzívnym futbalistom, ktorý väčšinou hrával ľavou nohou. Uštedriť gól však dokázal aj pravou nohou či hlavou.
Ako človek bol tichší a nekonfliktný, no na hracej ploche sa prejavoval ako prirodzený vodca. V Slovane bol jednoznačne najväčším ťahúňom pod vedúcou rukou trénera Dušana Galisa.
V sezóne 1991/1992 sa zišli v Slovane hviezdy ako Glonek, Kinder, Krištofík, Pecko, Haraoui a hlavne Peter Dubovský, ktorí lákali davy návštevníkov. V súboji s Vítkovicami získal Slovan majstrovský titul. V roku 1992 sa stal so svojimi 27 gólmi kráľom strelcov. A veľmi podobne to bolo aj v nasledujúcej sezóne.
Slovan sa dostal do ligy Pohár UEFA, kedy sa dostal do súboja so slávnym Realom Madrid. Slovan prehral 1:2 a jeden gól, ktorý sa podarilo streliť, bol Dubovského. V odvete Slovan remizoval na Santiago Bernabéu a z pohára vypadol. Práve v zápase s Realom zachytili Petra Dubovského madridskí funkcionári.
Po sezóne 1992/1993 odišiel Dubovský do Madridu, kde v prvej sezóne pravidelne nastupoval. Za 26 zápasov sa mu podarilo streliť len jeden gól a zrejme preto v ďalšej sezóne nastupoval len sporadicky.
Prestúpil teda do Ovieda, kde hral päť sezón, strelil 17 gólov a stal sa ťahúňom mužstva.
V československej reprezentácií debutoval už ako 19 ročný v zápase so Španielskom. V červenom drese odohral 14 zápasov a strelil krásnych 9 gólov.
Pamätný zostal jeho hetrik v Košiciach v kvalifikačnom zápase o postup na MS proti Rumunom.
Po rozdelení federácie sa stal lídrom slovenskej reprezentácie, počas 33 zápasov strelil 12 gólov.
Okrem futbalu Peter Dubovský veľmi rád fotografoval. Ako správny fotograf hľadal aj vhodné pozadie na fotku, správny uhol pohľadu. Táto záľuba sa mu napokon stala osudnou.
Na znak úcty sa od roku 2000 každý rok odovzdáva Cena Petra Dubovského, ktorá je určená pre mladé talenty do 21 rokov. Od tohto roku tiež futbalový klub ŠK Slovan Bratislava organizuje na jeho počesť turnaj futbalových prípraviek Spomienka na Petra Dubovského.
Futbalová kariéra Petra Dubovského v skratke:
Vinohrady Bratislava
Slovan Bratislava /94 zápasov, 59 gólov/
Real Madrid /31 zápasov, 2 góly/
Real Oviedo /120 zápasov, 17 gólov/
Petrove úspechy: dvojnásobný kráľ strelcov vo federálnej lige (1991/1992 a 1992/1993)
Ocenenia:
1993 – 2.miesto v ankete Najlepší športovec Slovenska
1993 - 1.miesto v ankete Najlepší športovec Slovenska
1994 - 3.miesto v ankete Najlepší športovec Slovenska
1995 - 3.miesto v ankete Najlepší športovec Slovenska
1996 - 2.miesto v ankete Najlepší športovec Slovenska
Prezývali ho Bobo, Dubo, Dubák.